MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL01

Total Repeats: 605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018742	ATAA	2	8	20	27	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018742	A	6	6	3140	3145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018742	TAT	2	6	3146	3151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018742	ATA	2	6	3155	3160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018742	AT	3	6	3172	3177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018742	T	7	7	8781	8787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018742	GCTTT	2	10	8807	8816	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018742	T	7	7	8814	8820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018742	ATT	2	6	8825	8830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018742	AGCCA	2	10	9312	9321	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_018742	AAC	2	6	9340	9345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018742	A	6	6	10419	10424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018742	TAGGG	2	10	11313	11322	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018742	T	6	6	12030	12035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018742	T	7	7	12056	12062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018742	AGAT	2	8	12064	12071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018742	T	6	6	12099	12104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018742	CTT	2	6	12130	12135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018742	GTCA	2	8	12286	12293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018742	TGA	2	6	12342	12347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018742	AGG	2	6	12359	12364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018742	ATA	2	6	12367	12372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018742	TGTA	2	8	12418	12425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018742	TTCA	2	8	12483	12490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018742	TTCAT	2	10	12506	12515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018742	GAA	2	6	12550	12555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018742	TG	3	6	12580	12585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018742	TAAT	2	8	12595	12602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018742	TTTC	2	8	12603	12610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018742	ATA	2	6	12666	12671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018742	CTT	2	6	12672	12677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018742	ATA	2	6	12704	12709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018742	AG	3	6	12716	12721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018742	ATA	2	6	18926	18931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018742	TAA	2	6	18944	18949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018742	TTGTA	2	10	18958	18967	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018742	T	6	6	18968	18973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018742	TGAT	2	8	18977	18984	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018742	TCA	2	6	18995	19000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018742	T	6	6	19005	19010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018742	A	8	8	19026	19033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018742	AAGC	2	8	19077	19084	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018742	AGC	2	6	19090	19095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018742	T	7	7	19987	19993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018742	A	7	7	20018	20024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018742	TTG	2	6	20081	20086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018742	CCA	2	6	20091	20096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_018742	ATA	2	6	20130	20135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018742	CCA	2	6	20152	20157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018742	TTA	2	6	25542	25547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018742	TGT	2	6	25581	25586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018742	T	6	6	25619	25624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018742	ATA	2	6	25635	25640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018742	T	7	7	25645	25651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018742	TGT	2	6	25679	25684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018742	AAT	2	6	25711	25716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018742	TTG	2	6	25764	25769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018742	ATT	2	6	25778	25783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018742	TCA	2	6	25791	25796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018742	AGA	2	6	25817	25822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018742	T	7	7	25832	25838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018742	T	6	6	29311	29316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018742	A	9	9	29360	29368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018742	TGTA	2	8	29403	29410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018742	TCG	2	6	29459	29464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018742	CCG	2	6	29467	29472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018742	A	7	7	31480	31486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018742	TAAA	2	8	31506	31513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018742	GT	3	6	31530	31535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018742	TAT	2	6	31550	31555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018742	TGT	2	6	31556	31561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018742	CAA	2	6	32679	32684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018742	A	8	8	32765	32772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018742	TAT	2	6	33465	33470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018742	AT	3	6	33490	33495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018742	TAAT	2	8	33530	33537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018742	ATG	2	6	33572	33577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018742	AATT	2	8	33588	33595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018742	ACAT	2	8	33662	33669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018742	T	7	7	34058	34064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018742	ATT	2	6	34078	34083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018742	AATT	2	8	34094	34101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018742	TAT	2	6	34120	34125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018742	TTC	2	6	35536	35541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018742	AAT	2	6	35573	35578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018742	AC	3	6	35726	35731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018742	AT	4	8	35734	35741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018742	AGA	2	6	35762	35767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018742	CATT	2	8	35782	35789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018742	AT	4	8	35810	35817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018742	ATG	2	6	35885	35890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018742	ACA	2	6	35948	35953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018742	TCA	2	6	35982	35987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018742	ATG	2	6	36001	36006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018742	GAGAAA	2	12	36011	36022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018742	GA	4	8	36033	36040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018742	AAT	2	6	36050	36055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018742	ATA	2	6	36080	36085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018742	T	6	6	36146	36151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018742	TAT	2	6	36162	36167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018742	AGT	2	6	36217	36222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018742	ATA	2	6	36329	36334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018742	ACA	2	6	36366	36371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018742	TAAT	2	8	36375	36382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018742	TTG	2	6	36391	36396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018742	TAAA	2	8	36407	36414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018742	TAA	2	6	39870	39875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018742	GTT	2	6	40635	40640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018742	TAAA	2	8	40656	40663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018742	TAAA	2	8	40711	40718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018742	T	6	6	40729	40734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018742	TA	3	6	40763	40768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018742	ATA	2	6	40780	40785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018742	ACC	2	6	40803	40808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_018742	CT	3	6	40868	40873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018742	TTC	2	6	40953	40958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018742	T	6	6	41005	41010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018742	T	6	6	41076	41081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018742	ATTCT	2	10	41152	41161	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018742	CTA	2	6	41199	41204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018742	T	6	6	41216	41221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018742	AAAG	2	8	41772	41779	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018742	T	6	6	41791	41796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018742	AAAT	2	8	41822	41829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018742	TAC	2	6	43392	43397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018742	A	6	6	43430	43435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018742	AAT	2	6	47671	47676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018742	AGC	2	6	47763	47768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018742	AAG	2	6	48732	48737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018742	GAT	2	6	48763	48768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018742	GAG	2	6	48773	48778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018742	TAAT	2	8	48796	48803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018742	CA	3	6	48833	48838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018742	CCA	2	6	48865	48870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_018742	A	6	6	48967	48972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018742	TTG	2	6	49035	49040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018742	A	7	7	49068	49074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018742	TTG	2	6	49143	49148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018742	TTG	2	6	49175	49180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018742	TTTAA	2	10	49785	49794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018742	TTAT	2	8	49844	49851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018742	AGT	2	6	49929	49934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018742	TAT	2	6	49953	49958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018742	GAT	2	6	49986	49991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018742	GAG	2	6	49996	50001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018742	TTAAAA	2	12	50016	50027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018742	CA	3	6	50056	50061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018742	CCA	2	6	50088	50093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_018742	A	6	6	50116	50121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_018742	TCG	2	6	156618	156623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_018742	ACATA	2	10	157298	157307	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

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